在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

探析最终

1、从光敏养育组织细胞中去除DNA交连蛋清质

为了能够分离整理光交连蛋清质-DNA包覆物用作LC-MS了解，笔者开发技术半个种退行纯化方案怎么写，可从DNA中洗去非你交连蛋清质，仅在影响时使用真接表观遗传组学习丰度DNA交连蛋清质。用TRIZOL取出染色剂质并洗去入狱获的非交连蛋清，并且将其之后溶解完以实现RNase化解。使用超音波切面应纳税所得额蛋清质交连DNA的取出物，在硫氰酸胍中蒸煮退行，并在二腐蚀硅抽滤柱上巨烈洗條以洗去非你交连蛋清质直接左右顺利完成。使用核酸酶整理从DNA中放出光交连蛋清，并实现胰蛋清酶化解用作LC-MS了解。该方法步骤重命名为蛋清质交连DNA取出或XDNAX。

图1.球脂肪酸交连DNA获取或XDNAX工作流程表（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可直接性排斥DNA的蛋清质图谱

将光化学交联方式方法技术应用于MCF7神经元，找到了1,805种备选核脂肪酸，各举1,191种具有于3个或一些次按顺序中。60%的DNA相互间能力组含带核酸紧密联系的GO标注，在存在核酸紧密联系标注的核脂肪酸质中，极限的贡献奖产自核纤层核脂肪酸，此外是参加染色法质组织开展和神经元裂变的核脂肪酸质（图2）。

图2 . 可直接的触碰 DNA 的核高蛋白（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3分析了DNA间接帮助组所暗含的血清质-DNA菜单栏试述包涵的核苷酸热塑肽。这收录可能（1）球状DNA综合设计域、（2）DNA 综合周期性区（IDR）和（3）可能与别的血清质（假如组血清综合血清）、RNA（假如剪接细胞因子）或相剥离 区室（假如核仁血清）间接帮助而引发的情况快要。

图3 . 可真接学习 DNA的空间结构域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、降钙素原检测神经元扰动时期与DNA组合的转录细胞

雌肾上腺素多巴胺受体α（ESR1）驻在胞质溶胶中，直至会遇到其配体，引起易位到组织細胞，在那边它与dna组中的指定部分联系以更改密码指定的转录系统软件。将血清饥饿的MCF7组织細胞暴漏于高摄入量雌肾上腺素（10 nM 17β-雌二醇）44分，与虚拟仿真处置的照表组织細胞相对同旁内角的DNA互为效果组（图4A）。这之中，雌肾上腺素伤害性后DNA互为效果组中的ESR1增大了30倍（图4B）。总的再说，在1,814个降钙素原检测的淀粉酶质-DNA互为效果中，约有9%表现出突破2倍的正相关波动，并观察动物到与ESR1都具有互为效果的淀粉酶如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌荷尔蒙处置乳线癌上皮细胞 DNA 相护能力组的降钙素原检测较好（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

论述流入表观遗传组的球高血清以了解一下它是怎样才能被读入并付诸操作的，一只是科研工作员工某个短期的需求。表观遗传组可及性主要以DNA为中心站的角度看采取论述，但是，到日前说不定，染色剂质凝露中的哪几种球高血清与DNA 有高中物理互为功用尚不明了。用零距里光交连，可遇到DNA互为功用组中的绝大部分数球高血清，XDNAX系统将做为球高血清-DNA互为功用论述的庞大手段。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的血清质组学、掩盖组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参考使用论文毕业论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.